广州医大杂志社有限责任公司成立于2018年9月，为广州医科大学独资成立的国有企业。目前为广州医科大学资产经营有限公司属下子公司，广州市国有企业。广州医大杂志社有限责任公司秉承“服务期刊，管好账目”的宗旨，为广医主办、承办的杂志管好账，做好服务；同时促进广医各刊学术交流，为提升各刊影响力做出贡献。

2016年以来，为响应我国新闻管理部门对学术期刊运作方式的政策规定，解决广医杂志群运作过程遇到的困难，广州医科大学根据校党委、校长办公会的指示，于2018年9月注册成立“广州医大杂志社有限责任公司”企业法人，为广州医科大学及下属单位主管、主办和承办的各学术期刊的财务运行提供规范的管理平台。杂志社平台的建立，初步解决了制约广医杂志群个体发展的一个瓶颈。不仅如此，以平台为依托，广医杂志社在过去二十年来第一次将广医旗下杂志群真正地凝聚在一起，形成了相依相存、同舟共济的互动关系，为未来的发展夯实基础。我校企业法人化的杂志系统短时间内克服理顺各种历史问题，在广州地区属于先行者。南方医科大学等多家单位曾多次前来调研。充分说明在我校领导的正确决策下，经过数年运作，广医杂志社在国内已经取得一定影响，在广东高校杂志运作开辟出一条独特的新路。

广州医科大学及附属医院主办、承办的杂志包括《中华生物医学工程杂志》《广州医科大学学报》《血栓与止血学》《中华临床实验室管理电子杂志》《中华关节外科杂志（电子版）》《中华产科急救电子杂志》《Journal of Thoracic Disease》。